С 1991 года филиалами музея стали родные дома легендарных литовских пилотов Стяпонаса Дарюса и Стасиса Гиренаса. Там созданы мемориальные экспозиции рассказывающие о перелёте наших лётчиков через Атлантический океан в 1933 году, дополненные этнографическими экспонатами Жемайтии (этнический регион Литвы).

Коллекция музея насчитывает около 20 000 экспонатов (в том числе более 40 самолетов), площадь экспозиции – 4700 квадратных метров, крупногабаритные самолеты, вертолёты и противопожарная техника расположены на открытой площадке. Специализированная библиотека музея насчитывает около 19 000 публикаций авиационной тематики.

Самый популярный экспонат – летающая копия легендарного самолета „Литуаника“ („Lituanica“), разработана и изготовлена известным авиатором Литвы Владасом Кенсгайлой в 1982 году. Копия использовалась при создании фильма „Перелёт через Атлантику“, имеет сертификат лётной годности и может демонстрироватся в полёте. Сертификаты лётной годности имеют планеры „Олимпия“ и Кa 2.

Гордость музея – построенные и эксплуатировавшиеся в Литве планеры, среди которых выделяется коллекция планеров Бронюса Ошкиниса. В экспозиции представлены спортивные самолеты, самолеты литовских и польских ВВС, вертолеты. На открытой площадке – участник легендарной акции „Балтийский путь“ 1989 года – самолет Ан-2. В экспозиции музея находится мемориальная крипта С. Дарюса и С. Гиренаса и мемориальная комната авиаконструктора Антанаса Густайтиса, коллекция авиационных двигателей, действует специализированная экспозиция истории пожарного дела, посетители могут посидеть в тренажёре самолета Ан-2 или в макете кабины пилотов вертолета Ми-8. В конференц-зале музея проводятся демонстрация фильмов на авиационную тематику.,