Коллекция музея состоит из археологических находок, холодного и огнестрельного оружия, наборы амуниции, свидетельствующие о развитии истории Литовского государства и военного дела; предметы и документы, коллекции фотографий и негативов, повествующие о полете через Атлантику самолета «Lituanicа»; коллекция военных форм иностранных армий, сборник документов и книг.
Музей собирает, хранит, реставрирует, исследует и пропагандирует памятники, экспонаты борьбы литовского народа и Литовского государства за свободу и независимость, которые рассказывают об истории Литвы, эволюции оружия и военной символики, материальных и духовных культурных ценностей, представляющих историю Литовского и других государств, о военном искусстве с древнейших времен до наших дней.